「フレッツ・あずけ～る」で共有しているフォルダ/ファイルへアクセス権限の設定はできますか？

「フレッツ・あずけ～る」で共有しているフォルダ/ファイルへアクセス権限の設定はできますか？

はい、設定可能です。

「フレッツ・あずけ～る」お客さまページで、グループフォルダ配下のフォルダ単位に、利用者ログインIDごとの許可/不許可のアクセス権限設定ができます。
ただし、アクセス権限の設定は、管理者IDのみとなります。